Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX15Q9NRS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX15Q9NRS6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX15Q9NRS6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms