Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB55

CYP3A43, Cytochrome P450 3A43, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A43Q9HB55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYP3A43Q9HB55 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYP3A43Q9HB55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYP3A43Q9HB55 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms