Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGU0

TSPO2, Translocator protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPO2Q5TGU0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TSPO2Q5TGU0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TSPO2Q5TGU0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms