Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
NESP48681 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
NESP48681 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.02
NESP48681 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
NESP48681 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NESP48681 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NESP48681 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
NESP48681 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.12■■■■■ 4.01
NESP48681 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
NESP48681 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
NESP48681 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
NESP48681 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
NESP48681 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
NESP48681 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NESP48681 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NESP48681 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
NESP48681 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
NESP48681 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
NESP48681 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NESP48681 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
NESP48681 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC40.05■■■■■ 4
NESP48681 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
NESP48681 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
NESP48681 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
NESP48681 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
NESP48681 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
NESP48681 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
NESP48681 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
NESP48681 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
NESP48681 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
NESP48681 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
NESP48681 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.9 ms