Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBA1P22314 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBA1P22314 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBA1P22314 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBA1P22314 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBA1P22314 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBA1P22314 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBA1P22314 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBA1P22314 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBA1P22314 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBA1P22314 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBA1P22314 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA1P22314 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
UBA1P22314 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms