Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PABPC1P11940 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PABPC1P11940 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PABPC1P11940 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms