Protein–RNA interactions for Protein: A6NIE6

RRN3P2, Putative RRN3-like protein RRN3P2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P2A6NIE6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRN3P2A6NIE6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RRN3P2A6NIE6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RRN3P2A6NIE6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms