Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HES2Q9Y543 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HES2Q9Y543 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HES2Q9Y543 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms