Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IL1RAPQ9NPH3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IL1RAPQ9NPH3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IL1RAPQ9NPH3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IL1RAPQ9NPH3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms