RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219150.9

CORO1A-201, Transcript of coronin 1A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CORO1A, Length 1,803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CORO1A-201ENST00000219150 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.25■■■■■ 5.8
CORO1A-201ENST00000219150 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.95■■■■■ 4.79
CORO1A-201ENST00000219150 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.95■■■■■ 4.47
CORO1A-201ENST00000219150 ABCC9O60706 1549 aa42.91■■■■■ 4.46
CORO1A-201ENST00000219150 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.56■■■■■ 4.4
CORO1A-201ENST00000219150 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.36■■■■■ 4.37
CORO1A-201ENST00000219150 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.04■■■■■ 4.32
CORO1A-201ENST00000219150 NACADO15069 1562 aa41.96■■■■■ 4.31
CORO1A-201ENST00000219150 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.74■■■■■ 4.27
CORO1A-201ENST00000219150 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.51■■■■■ 4.24
CORO1A-201ENST00000219150 SCRIBQ14160 1630 aa41.28■■■■■ 4.2
CORO1A-201ENST00000219150 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.91■■■■■ 4.14
CORO1A-201ENST00000219150 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.44■■■■■ 4.06
CORO1A-201ENST00000219150 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.37■■■■■ 4.05
CORO1A-201ENST00000219150 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.85■■■■□ 3.97
CORO1A-201ENST00000219150 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.72■■■■□ 3.95
CORO1A-201ENST00000219150 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.65■■■■□ 3.94
CORO1A-201ENST00000219150 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.58■■■■□ 3.93
CORO1A-201ENST00000219150 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.56■■■■□ 3.92
CORO1A-201ENST00000219150 SMARCA4P51532 1647 aa39.52■■■■□ 3.92
CORO1A-201ENST00000219150 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.29■■■■□ 3.88
CORO1A-201ENST00000219150 WIZO95785 1651 aa39.27■■■■□ 3.88
CORO1A-201ENST00000219150 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.03■■■■□ 3.84
CORO1A-201ENST00000219150 SMARCA2P51531 1590 aa38.97■■■■□ 3.83
CORO1A-201ENST00000219150 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.96■■■■□ 3.83
CORO1A-201ENST00000219150 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.84■■■■□ 3.81
CORO1A-201ENST00000219150 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
CORO1A-201ENST00000219150 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
CORO1A-201ENST00000219150 NCAPD3P42695 1498 aa38.7■■■■□ 3.79
CORO1A-201ENST00000219150 HMGXB3Q12766 1538 aa38.63■■■■□ 3.77
CORO1A-201ENST00000219150 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.41■■■■□ 3.74
CORO1A-201ENST00000219150 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.22■■■■□ 3.71
CORO1A-201ENST00000219150 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.73■■■■□ 3.63
CORO1A-201ENST00000219150 CFTRP13569 1480 aa37.72■■■■□ 3.63
CORO1A-201ENST00000219150 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.69■■■■□ 3.62
CORO1A-201ENST00000219150 PRDM2Q13029 1718 aa37.59■■■■□ 3.61
CORO1A-201ENST00000219150 NESP48681 1621 aa37.52■■■■□ 3.6
CORO1A-201ENST00000219150 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.51■■■■□ 3.6
CORO1A-201ENST00000219150 ABCC8Q09428 1581 aa37.48■■■■□ 3.59
CORO1A-201ENST00000219150 TRIM41Q8WV44 630 aa37.39■■■■□ 3.58
CORO1A-201ENST00000219150 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.29■■■■□ 3.56
CORO1A-201ENST00000219150 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.29■■■■□ 3.56
CORO1A-201ENST00000219150 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.23■■■■□ 3.55
CORO1A-201ENST00000219150 SYNJ1O43426 1573 aa37.15■■■■□ 3.54
CORO1A-201ENST00000219150 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.12■■■■□ 3.53
CORO1A-201ENST00000219150 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.11■■■■□ 3.53
CORO1A-201ENST00000219150 TOP2BQ02880 1626 aa37.04■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 CUX1P39880 1505 aa37.04■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.02■■■■□ 3.52
CORO1A-201ENST00000219150 ERCC6Q03468 1493 aa36.88■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.87■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 TOPBP1Q92547 1522 aa36.83■■■■□ 3.49
CORO1A-201ENST00000219150 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.77■■■■□ 3.48
CORO1A-201ENST00000219150 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
CORO1A-201ENST00000219150 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
CORO1A-201ENST00000219150 SOGA1O94964 1423 aa36.65■■■■□ 3.46
CORO1A-201ENST00000219150 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
CORO1A-201ENST00000219150 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CORO1A-201ENST00000219150 WDR62O43379 1518 aa36.58■■■■□ 3.45
CORO1A-201ENST00000219150 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.54■■■■□ 3.44
CORO1A-201ENST00000219150 EEA1Q15075 1411 aa36.5■■■■□ 3.43
CORO1A-201ENST00000219150 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.48■■■■□ 3.43
CORO1A-201ENST00000219150 CUX2O14529 1486 aa36.4■■■■□ 3.42
CORO1A-201ENST00000219150 KIF27Q86VH2 1401 aa36.39■■■■□ 3.42
CORO1A-201ENST00000219150 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.38■■■■□ 3.41
CORO1A-201ENST00000219150 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.35■■■■□ 3.41
CORO1A-201ENST00000219150 WDR97A6NE52 1622 aa36.32■■■■□ 3.4
CORO1A-201ENST00000219150 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
CORO1A-201ENST00000219150 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.28■■■■□ 3.4
CORO1A-201ENST00000219150 IFT140Q96RY7 1462 aa36.24■■■■□ 3.39
CORO1A-201ENST00000219150 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.21■■■■□ 3.39
CORO1A-201ENST00000219150 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
CORO1A-201ENST00000219150 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.13■■■■□ 3.38
CORO1A-201ENST00000219150 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.1■■■■□ 3.37
CORO1A-201ENST00000219150 IGF1RP08069 1367 aa36.08■■■■□ 3.37
CORO1A-201ENST00000219150 KIF21BO75037 1637 aa36.06■■■■□ 3.36
CORO1A-201ENST00000219150 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.04■■■■□ 3.36
CORO1A-201ENST00000219150 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.03■■■■□ 3.36
CORO1A-201ENST00000219150 PRXQ9BXM0 1461 aa35.99■■■■□ 3.35
CORO1A-201ENST00000219150 GOLGA3Q08378 1498 aa35.99■■■■□ 3.35
CORO1A-201ENST00000219150 PBRM1Q86U86 1689 aa35.97■■■■□ 3.35
CORO1A-201ENST00000219150 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.96■■■■□ 3.35
CORO1A-201ENST00000219150 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
CORO1A-201ENST00000219150 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.93■■■■□ 3.34
CORO1A-201ENST00000219150 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.92■■■■□ 3.34
CORO1A-201ENST00000219150 CUL7Q14999 1698 aa35.91■■■■□ 3.34
CORO1A-201ENST00000219150 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
CORO1A-201ENST00000219150 GRIN2BQ13224 1484 aa35.88■■■■□ 3.33
CORO1A-201ENST00000219150 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.76■■■■□ 3.32
CORO1A-201ENST00000219150 ADAMTS12P58397 1594 aa35.7■■■■□ 3.31
CORO1A-201ENST00000219150 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.7■■■■□ 3.3
CORO1A-201ENST00000219150 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.68■■■■□ 3.3
CORO1A-201ENST00000219150 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
CORO1A-201ENST00000219150 CEP162Q5TB80 1403 aa35.55■■■■□ 3.28
CORO1A-201ENST00000219150 HRCP23327 699 aa35.52■■■■□ 3.28
CORO1A-201ENST00000219150 SYNJ2O15056 1496 aa35.5■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 PCGF6Q9BYE7 350 aa35.48■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa35.47■■■■□ 3.27
CORO1A-201ENST00000219150 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.1 ms