Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GINS3Q9BRX5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GINS3Q9BRX5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms