Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNGAP1Q96PV0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNGAP1Q96PV0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYNGAP1Q96PV0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms