Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SKAP1Q86WV1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SKAP1Q86WV1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms