Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
LRRC9Q6ZRR7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRRC9Q6ZRR7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRRC9Q6ZRR7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRRC9Q6ZRR7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms