Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPIRE1Q08AE8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPIRE1Q08AE8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPIRE1Q08AE8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms