Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NESP48681 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
NESP48681 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
NESP48681 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
NESP48681 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NESP48681 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NESP48681 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
NESP48681 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
NESP48681 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
NESP48681 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
NESP48681 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
NESP48681 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
NESP48681 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
NESP48681 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NESP48681 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
NESP48681 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
NESP48681 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC40.28■■■■■ 4.04
NESP48681 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
NESP48681 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
NESP48681 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NESP48681 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
NESP48681 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
NESP48681 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
NESP48681 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
NESP48681 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
NESP48681 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NESP48681 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NESP48681 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC40.23■■■■■ 4.03
NESP48681 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
NESP48681 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
NESP48681 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
NESP48681 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
NESP48681 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
NESP48681 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
NESP48681 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
NESP48681 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.03
NESP48681 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
NESP48681 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NESP48681 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
NESP48681 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NESP48681 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
NESP48681 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NESP48681 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC40.18■■■■■ 4.02
NESP48681 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
NESP48681 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
NESP48681 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
NESP48681 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
NESP48681 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms