Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NME2P22392 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME2P22392 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME2P22392 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NME2P22392 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NME2P22392 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
NME2P22392 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
NME2P22392 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NME2P22392 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NME2P22392 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NME2P22392 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NME2P22392 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms