Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIN4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
A6NIN4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
A6NIN4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
A6NIN4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
A6NIN4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
A6NIN4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
A6NIN4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
A6NIN4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
A6NIN4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
A6NIN4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
A6NIN4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms