Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C1QTNF1Q9BXJ1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C1QTNF1Q9BXJ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C1QTNF1Q9BXJ1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms