Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MYD88Q99836 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
MYD88Q99836 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MYD88Q99836 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms