Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYT2Q8N9I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYT2Q8N9I0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT2Q8N9I0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms