Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTF2IP78347 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IP78347 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IP78347 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms