Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 56.68□□□□□ -1.341e-323■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 ST6GAL1-205ENST00000427315 544 ntTSL 422.88■■□□□ 1.255e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 ST6GAL1-222ENST00000487031 592 ntTSL 422.54■■□□□ 1.25e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 SPPL3-207ENST00000543608 636 ntTSL 318.21■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 CCDC88C-209ENST00000554872 1165 ntTSL 418.05■□□□□ 0.485e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)17.41■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.335e-17■■■■■ 40.8
DKC1O60832 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.095e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.035e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.325e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 CCDC88C-208ENST00000554165 420 ntTSL 312.93□□□□□ -0.345e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-8■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.595e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 TCAF1-203ENST00000460532 840 ntTSL 211.03□□□□□ -0.645e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 PTCHD4-202ENST00000398738 3232 ntTSL 1 (best)10.2□□□□□ -0.785e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 ST6GAL1-206ENST00000430309 504 ntTSL 49.78□□□□□ -0.845e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.945e-9■■■■■ 40.8
DKC1O60832 ST6GAL1-203ENST00000417392 707 ntTSL 29.14□□□□□ -0.955e-9■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 PAFAH1B1-205ENST00000571495 1503 ntTSL 26.7□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 40.8
DKC1O60832 PAFAH1B1-206ENST00000572915 1361 ntTSL 1 (best)6.54□□□□□ -1.366e-7■■■■■ 40.8
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DKC1O60832 OGDHL-201ENST00000374103 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.747e-7■■■■■ 40.7
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DKC1O60832 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 212.61□□□□□ -0.391e-323■■■■■ 40.6
DKC1O60832 SNORA71E-201ENST00000365032 132 ntBASIC10.89□□□□□ -0.671e-80■■■■■ 40.6
DKC1O60832 KDM4B-205ENST00000588337 504 ntTSL 530.14■■■□□ 2.422e-6■■■■■ 40.6
DKC1O60832 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 40.6
DKC1O60832 ARHGAP40-201ENST00000243967 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.01■□□□□ 0.154e-8■■■■■ 40.6
DKC1O60832 ARHGAP40-202ENST00000373345 2841 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 40.6
DKC1O60832 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 40.6
DKC1O60832 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 40.6
DKC1O60832 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.772e-9■■■■■ 40.4
DKC1O60832 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-9■■■■■ 40.4
DKC1O60832 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.071e-7■■■■■ 40.3
DKC1O60832 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 40.3
DKC1O60832 NPHP4-206ENST00000468253 781 ntTSL 222.53■■□□□ 1.24e-7■■■■■ 40.2
DKC1O60832 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.913e-8■■■■■ 40.1
DKC1O60832 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.333e-8■■■■■ 40.1
DKC1O60832 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.393e-8■■■■■ 40.1
DKC1O60832 PCNT-205ENST00000480896 10485 ntTSL 1 (best)11.67□□□□□ -0.544e-10■■■■■ 40.1
DKC1O60832 SP1-202ENST00000426431 7603 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-24■■■■■ 40.1
DKC1O60832 PCNT-201ENST00000359568 10560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 40.1
DKC1O60832 CDC42EP4-205ENST00000580315 1022 ntTSL 227.9■■■□□ 2.063e-10■■■■■ 40
DKC1O60832 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.643e-10■■■■■ 40
DKC1O60832 CDC42EP4-204ENST00000579611 580 ntTSL 419.06■□□□□ 0.643e-10■■■■■ 40
DKC1O60832 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.383e-10■■■■■ 40
DKC1O60832 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.153e-10■■■■■ 40
DKC1O60832 FLCN-210ENST00000577591 296 ntTSL 217.57■□□□□ 0.43e-9■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-207ENST00000565069 813 ntTSL 321.92■■□□□ 1.17e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-208ENST00000563837 705 ntTSL 221.32■■□□□ 17e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.97e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-205ENST00000565467 3726 ntTSL 1 (best)19.94■□□□□ 0.787e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 AC009041.2-203ENST00000562570 3222 ntTSL 1 (best)18.7■□□□□ 0.587e-7■■■■■ 39.9
DKC1O60832 LMF1-215ENST00000570014 882 ntTSL 518.58■□□□□ 0.567e-7■■■■■ 39.9
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