RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586065.1

PTPRS-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRS, Length 388 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-203ENST00000586065 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.69■■■■□ 3.14
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC9O60706 1549 aa31.25■■■□□ 2.59
PTPRS-203ENST00000586065 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.8■■■□□ 2.52
PTPRS-203ENST00000586065 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.04■■■□□ 2.4
PTPRS-203ENST00000586065 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRS-203ENST00000586065 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.13■■■□□ 2.25
PTPRS-203ENST00000586065 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
PTPRS-203ENST00000586065 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.99■■■□□ 2.23
PTPRS-203ENST00000586065 NACADO15069 1562 aa28.92■■■□□ 2.22
PTPRS-203ENST00000586065 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.74■■■□□ 2.19
PTPRS-203ENST00000586065 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.72■■■□□ 2.19
PTPRS-203ENST00000586065 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.5■■■□□ 2.15
PTPRS-203ENST00000586065 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.45■■■□□ 2.14
PTPRS-203ENST00000586065 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
PTPRS-203ENST00000586065 SCRIBQ14160 1630 aa28.12■■■□□ 2.09
PTPRS-203ENST00000586065 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.07■■■□□ 2.08
PTPRS-203ENST00000586065 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.96■■■□□ 2.07
PTPRS-203ENST00000586065 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.92■■■□□ 2.06
PTPRS-203ENST00000586065 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
PTPRS-203ENST00000586065 CUX2O14529 1486 aa27.06■■□□□ 1.92
PTPRS-203ENST00000586065 ERCC6Q03468 1493 aa26.97■■□□□ 1.91
PTPRS-203ENST00000586065 SMARCA4P51532 1647 aa26.91■■□□□ 1.9
PTPRS-203ENST00000586065 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
PTPRS-203ENST00000586065 NCAPD3P42695 1498 aa26.81■■□□□ 1.88
PTPRS-203ENST00000586065 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.77■■□□□ 1.88
PTPRS-203ENST00000586065 NESP48681 1621 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRS-203ENST00000586065 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.66■■□□□ 1.86
PTPRS-203ENST00000586065 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.65■■□□□ 1.86
PTPRS-203ENST00000586065 SMARCA2P51531 1590 aa26.62■■□□□ 1.85
PTPRS-203ENST00000586065 TRIM41Q8WV44 630 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRS-203ENST00000586065 HMGXB3Q12766 1538 aa26.54■■□□□ 1.84
PTPRS-203ENST00000586065 WIZO95785 1651 aa26.5■■□□□ 1.83
PTPRS-203ENST00000586065 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
PTPRS-203ENST00000586065 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PTPRS-203ENST00000586065 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PTPRS-203ENST00000586065 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PTPRS-203ENST00000586065 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.19■■□□□ 1.78
PTPRS-203ENST00000586065 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.17■■□□□ 1.78
PTPRS-203ENST00000586065 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.07■■□□□ 1.76
PTPRS-203ENST00000586065 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.01■■□□□ 1.75
PTPRS-203ENST00000586065 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.97■■□□□ 1.75
PTPRS-203ENST00000586065 OSCARQ8IYS5 282 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRS-203ENST00000586065 WDR62O43379 1518 aa25.88■■□□□ 1.73
PTPRS-203ENST00000586065 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.86■■□□□ 1.73
PTPRS-203ENST00000586065 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
PTPRS-203ENST00000586065 CFTRP13569 1480 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRS-203ENST00000586065 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRS-203ENST00000586065 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRS-203ENST00000586065 PRDM2Q13029 1718 aa25.64■■□□□ 1.7
PTPRS-203ENST00000586065 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PTPRS-203ENST00000586065 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRS-203ENST00000586065 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRS-203ENST00000586065 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.45■■□□□ 1.66
PTPRS-203ENST00000586065 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.39■■□□□ 1.66
PTPRS-203ENST00000586065 ARHGEF11O15085 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRS-203ENST00000586065 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRS-203ENST00000586065 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRS-203ENST00000586065 IFT140Q96RY7 1462 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRS-203ENST00000586065 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRS-203ENST00000586065 TOPBP1Q92547 1522 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRS-203ENST00000586065 CUX1P39880 1505 aa25.12■■□□□ 1.61
PTPRS-203ENST00000586065 FBLN2P98095 1184 aa25.11■■□□□ 1.61
PTPRS-203ENST00000586065 ARAP1Q96P48 1450 aa25.09■■□□□ 1.61
PTPRS-203ENST00000586065 ABCC8Q09428 1581 aa25.08■■□□□ 1.61
PTPRS-203ENST00000586065 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.67e-6■■□□□ 12.2
PTPRS-203ENST00000586065 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
PTPRS-203ENST00000586065 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
PTPRS-203ENST00000586065 SYNJ1O43426 1573 aa24.99■■□□□ 1.59
PTPRS-203ENST00000586065 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
PTPRS-203ENST00000586065 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.97■■□□□ 1.59
PTPRS-203ENST00000586065 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.96■■□□□ 1.59
PTPRS-203ENST00000586065 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.95■■□□□ 1.58
PTPRS-203ENST00000586065 TOP2BQ02880 1626 aa24.94■■□□□ 1.58
PTPRS-203ENST00000586065 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
PTPRS-203ENST00000586065 CHD1O14646 1710 aa24.89■■□□□ 1.57
PTPRS-203ENST00000586065 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRS-203ENST00000586065 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
PTPRS-203ENST00000586065 WDR97A6NE52 1622 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRS-203ENST00000586065 SOGA1O94964 1423 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRS-203ENST00000586065 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
PTPRS-203ENST00000586065 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRS-203ENST00000586065 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.71■■□□□ 1.55
PTPRS-203ENST00000586065 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
PTPRS-203ENST00000586065 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRS-203ENST00000586065 PBRM1Q86U86 1689 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRS-203ENST00000586065 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRS-203ENST00000586065 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
PTPRS-203ENST00000586065 GRIN2BQ13224 1484 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRS-203ENST00000586065 SYNJ2O15056 1496 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRS-203ENST00000586065 ADAMTS12P58397 1594 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRS-203ENST00000586065 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRS-203ENST00000586065 KIF27Q86VH2 1401 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRS-203ENST00000586065 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRS-203ENST00000586065 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.32■■□□□ 1.48
PTPRS-203ENST00000586065 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.29■■□□□ 1.48
PTPRS-203ENST00000586065 CUL7Q14999 1698 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRS-203ENST00000586065 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRS-203ENST00000586065 IGF1RP08069 1367 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRS-203ENST00000586065 GRIN2AQ12879 1464 aa24.24■■□□□ 1.47
PTPRS-203ENST00000586065 CEP170Q5SW79 1584 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms