RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588337.5

KDM4B-205, Transcript of lysine demethylase 4B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM4B, Length 504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4B-205ENST00000588337 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.68■■■■■ 8.27
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KDM4B-205ENST00000588337 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.42■■■■■ 6.62
KDM4B-205ENST00000588337 NACADO15069 1562 aa56.18■■■■■ 6.58
KDM4B-205ENST00000588337 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.83■■■■■ 6.53
KDM4B-205ENST00000588337 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.62■■■■■ 6.49
KDM4B-205ENST00000588337 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.43■■■■■ 6.46
KDM4B-205ENST00000588337 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.29■■■■■ 6.44
KDM4B-205ENST00000588337 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.15■■■■■ 6.42
KDM4B-205ENST00000588337 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.89■■■■■ 6.38
KDM4B-205ENST00000588337 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.79■■■■■ 6.36
KDM4B-205ENST00000588337 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.65■■■■■ 6.34
KDM4B-205ENST00000588337 SCRIBQ14160 1630 aa54.37■■■■■ 6.29
KDM4B-205ENST00000588337 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.09■■■■■ 6.25
KDM4B-205ENST00000588337 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.38■■■■■ 6.14
KDM4B-205ENST00000588337 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.33■■■■■ 6.13
KDM4B-205ENST00000588337 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.02■■■■■ 6.08
KDM4B-205ENST00000588337 SMARCA4P51532 1647 aa51.94■■■■■ 5.91
KDM4B-205ENST00000588337 NCAPD3P42695 1498 aa51.8■■■■■ 5.88
KDM4B-205ENST00000588337 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.76■■■■■ 5.88
KDM4B-205ENST00000588337 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.74■■■■■ 5.87
KDM4B-205ENST00000588337 SMARCA2P51531 1590 aa51.68■■■■■ 5.86
KDM4B-205ENST00000588337 HMGXB3Q12766 1538 aa51.56■■■■■ 5.84
KDM4B-205ENST00000588337 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.43■■■■■ 5.82
KDM4B-205ENST00000588337 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.4■■■■■ 5.82
KDM4B-205ENST00000588337 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.3■■■■■ 5.8
KDM4B-205ENST00000588337 WIZO95785 1651 aa50.86■■■■■ 5.73
KDM4B-205ENST00000588337 ERCC6Q03468 1493 aa50.84■■■■■ 5.73
KDM4B-205ENST00000588337 NESP48681 1621 aa50.83■■■■■ 5.73
KDM4B-205ENST00000588337 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.61■■■■■ 5.69
KDM4B-205ENST00000588337 CUX2O14529 1486 aa50.56■■■■■ 5.68
KDM4B-205ENST00000588337 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.52■■■■■ 5.68
KDM4B-205ENST00000588337 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.31■■■■■ 5.64
KDM4B-205ENST00000588337 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.28■■■■■ 5.64
KDM4B-205ENST00000588337 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.25■■■■■ 5.63
KDM4B-205ENST00000588337 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.24■■■■■ 5.63
KDM4B-205ENST00000588337 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.21■■■■■ 5.63
KDM4B-205ENST00000588337 CFTRP13569 1480 aa49.84■■■■■ 5.57
KDM4B-205ENST00000588337 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.8■■■■■ 5.56
KDM4B-205ENST00000588337 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.73■■■■■ 5.55
KDM4B-205ENST00000588337 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.71■■■■■ 5.55
KDM4B-205ENST00000588337 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.71■■■■■ 5.55
KDM4B-205ENST00000588337 WDR62O43379 1518 aa49.7■■■■■ 5.55
KDM4B-205ENST00000588337 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.6■■■■■ 5.53
KDM4B-205ENST00000588337 PRDM2Q13029 1718 aa49.58■■■■■ 5.53
KDM4B-205ENST00000588337 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.29■■■■■ 5.48
KDM4B-205ENST00000588337 TOPBP1Q92547 1522 aa48.86■■■■■ 5.41
KDM4B-205ENST00000588337 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.77■■■■■ 5.4
KDM4B-205ENST00000588337 ABCC8Q09428 1581 aa48.77■■■■■ 5.4
KDM4B-205ENST00000588337 IFT140Q96RY7 1462 aa48.69■■■■■ 5.39
KDM4B-205ENST00000588337 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.65■■■■■ 5.38
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KDM4B-205ENST00000588337 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.41■■■■■ 5.34
KDM4B-205ENST00000588337 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
KDM4B-205ENST00000588337 CUX1P39880 1505 aa48.27■■■■■ 5.32
KDM4B-205ENST00000588337 OSCARQ8IYS5 282 aa48.24■■■■■ 5.31
KDM4B-205ENST00000588337 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.19■■■■■ 5.31
KDM4B-205ENST00000588337 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.18■■■■■ 5.3
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KDM4B-205ENST00000588337 SOGA1O94964 1423 aa48.12■■■■■ 5.29
KDM4B-205ENST00000588337 WDR97A6NE52 1622 aa47.99■■■■■ 5.27
KDM4B-205ENST00000588337 CHD1O14646 1710 aa47.96■■■■■ 5.27
KDM4B-205ENST00000588337 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.94■■■■■ 5.26
KDM4B-205ENST00000588337 TRIM41Q8WV44 630 aa47.79■■■■■ 5.24
KDM4B-205ENST00000588337 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.74■■■■■ 5.23
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KDM4B-205ENST00000588337 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
KDM4B-205ENST00000588337 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
KDM4B-205ENST00000588337 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
KDM4B-205ENST00000588337 TOP2BQ02880 1626 aa47.68■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 GRIN2BQ13224 1484 aa47.68■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 PBRM1Q86U86 1689 aa47.67■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.67■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 SYNJ1O43426 1573 aa47.66■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.65■■■■■ 5.22
KDM4B-205ENST00000588337 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.64■■■■■ 5.221e-6■■■■■ 58.5
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KDM4B-205ENST00000588337 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.62■■■■■ 5.21
KDM4B-205ENST00000588337 ARHGEF11O15085 1522 aa47.6■■■■■ 5.21
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KDM4B-205ENST00000588337 SYNJ2O15056 1496 aa47.46■■■■■ 5.19
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KDM4B-205ENST00000588337 ADAMTS12P58397 1594 aa47.21■■■■■ 5.15
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KDM4B-205ENST00000588337 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.11■■■■■ 5.13
KDM4B-205ENST00000588337 GRIN2AQ12879 1464 aa47.09■■■■■ 5.13
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KDM4B-205ENST00000588337 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.01■■■■■ 5.12
KDM4B-205ENST00000588337 CEP170Q5SW79 1584 aa46.94■■■■■ 5.1
KDM4B-205ENST00000588337 NUP160Q12769 1436 aa46.9■■■■■ 5.1
KDM4B-205ENST00000588337 SHROOM2Q13796 1616 aa46.7■■■■■ 5.07
KDM4B-205ENST00000588337 KIF27Q86VH2 1401 aa46.69■■■■■ 5.06
KDM4B-205ENST00000588337 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.67■■■■■ 5.06
KDM4B-205ENST00000588337 CUL7Q14999 1698 aa46.59■■■■■ 5.05
KDM4B-205ENST00000588337 IGF1RP08069 1367 aa46.56■■■■■ 5.04
KDM4B-205ENST00000588337 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.54■■■■■ 5.04
KDM4B-205ENST00000588337 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.36■■■■■ 5.01
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