RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524867.1

RPLP2-202, Transcript of ribosomal protein lateral stalk subunit P2, humanhuman

TSL 2

Gene RPLP2, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP2-202ENST00000524867 NISCHQ9Y2I1 1504 aa62.38■■■■■ 7.58
RPLP2-202ENST00000524867 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.68■■■■■ 6.5
RPLP2-202ENST00000524867 ABCC9O60706 1549 aa54.75■■■■■ 6.35
RPLP2-202ENST00000524867 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.55■■■■■ 6
RPLP2-202ENST00000524867 NACADO15069 1562 aa52.41■■■■■ 5.98
RPLP2-202ENST00000524867 DCAF8L2P0C7V8 631 aa52.13■■■■■ 5.94
RPLP2-202ENST00000524867 MYO15BQ96JP2 1530 aa52■■■■■ 5.92
RPLP2-202ENST00000524867 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
RPLP2-202ENST00000524867 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51.64■■■■■ 5.86
RPLP2-202ENST00000524867 UNC13AQ9UPW8 1703 aa51.37■■■■■ 5.81
RPLP2-202ENST00000524867 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP51.04■■■■■ 5.76
RPLP2-202ENST00000524867 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.98■■■■■ 5.75
RPLP2-202ENST00000524867 SCRIBQ14160 1630 aa50.73■■■■■ 5.71
RPLP2-202ENST00000524867 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.53■■■■■ 5.68
RPLP2-202ENST00000524867 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa50.46■■■■■ 5.67
RPLP2-202ENST00000524867 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.66■■■■■ 5.54
RPLP2-202ENST00000524867 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.54■■■■■ 5.52
RPLP2-202ENST00000524867 CECR2Q9BXF3 1484 aa49.25■■■■■ 5.47
RPLP2-202ENST00000524867 SMARCA4P51532 1647 aa48.5■■■■■ 5.36
RPLP2-202ENST00000524867 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
RPLP2-202ENST00000524867 NCAPD3P42695 1498 aa48.34■■■■■ 5.33
RPLP2-202ENST00000524867 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa48.31■■■■■ 5.32
RPLP2-202ENST00000524867 SMARCA2P51531 1590 aa48.26■■■■■ 5.32
RPLP2-202ENST00000524867 HMGXB3Q12766 1538 aa48.12■■■■■ 5.29
RPLP2-202ENST00000524867 MROH2BQ7Z745 1585 aa48.06■■■■■ 5.28
RPLP2-202ENST00000524867 PEG3Q9GZU2 1588 aa48.06■■■■■ 5.28
RPLP2-202ENST00000524867 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.9■■■■■ 5.26
RPLP2-202ENST00000524867 WIZO95785 1651 aa47.53■■■■■ 5.2
RPLP2-202ENST00000524867 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
RPLP2-202ENST00000524867 NESP48681 1621 aa47.27■■■■■ 5.16
RPLP2-202ENST00000524867 ERCC6Q03468 1493 aa47.23■■■■■ 5.15
RPLP2-202ENST00000524867 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa47.15■■■■■ 5.14
RPLP2-202ENST00000524867 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP47.03■■■■■ 5.12
RPLP2-202ENST00000524867 CUX2O14529 1486 aa46.89■■■■■ 5.1
RPLP2-202ENST00000524867 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.89■■■■■ 5.1
RPLP2-202ENST00000524867 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.8■■■■■ 5.08
RPLP2-202ENST00000524867 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.74■■■■■ 5.07
RPLP2-202ENST00000524867 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.7■■■■■ 5.07
RPLP2-202ENST00000524867 CFTRP13569 1480 aa46.57■■■■■ 5.04
RPLP2-202ENST00000524867 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.44■■■■■ 5.02
RPLP2-202ENST00000524867 FANCD2Q9BXW9 1451 aa46.38■■■■■ 5.01
RPLP2-202ENST00000524867 MRC2Q9UBG0 1479 aa46.38■■■■■ 5.01
RPLP2-202ENST00000524867 CEP164Q9UPV0 1460 aa46.36■■■■■ 5.01
RPLP2-202ENST00000524867 WDR62O43379 1518 aa46.25■■■■■ 4.99
RPLP2-202ENST00000524867 PRDM2Q13029 1718 aa46.23■■■■■ 4.99
RPLP2-202ENST00000524867 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.94■■■■■ 4.95
RPLP2-202ENST00000524867 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.81■■■■■ 4.92
RPLP2-202ENST00000524867 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
RPLP2-202ENST00000524867 TOPBP1Q92547 1522 aa45.6■■■■■ 4.89
RPLP2-202ENST00000524867 ABCC8Q09428 1581 aa45.57■■■■■ 4.89
RPLP2-202ENST00000524867 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.53■■■■■ 4.88
RPLP2-202ENST00000524867 IFT140Q96RY7 1462 aa45.4■■■■■ 4.86
RPLP2-202ENST00000524867 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP45.21■■■■■ 4.83
RPLP2-202ENST00000524867 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP45.19■■■■■ 4.82
RPLP2-202ENST00000524867 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP45.15■■■■■ 4.82
RPLP2-202ENST00000524867 CUX1P39880 1505 aa45.12■■■■■ 4.81
RPLP2-202ENST00000524867 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP45.07■■■■■ 4.8
RPLP2-202ENST00000524867 FGD5Q6ZNL6 1462 aa45.03■■■■■ 4.8
RPLP2-202ENST00000524867 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.97■■■■■ 4.79
RPLP2-202ENST00000524867 SOGA1O94964 1423 aa44.95■■■■■ 4.79
RPLP2-202ENST00000524867 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.89■■■■■ 4.781e-36■■■■■ 171.1
RPLP2-202ENST00000524867 WDR97A6NE52 1622 aa44.8■■■■■ 4.76
RPLP2-202ENST00000524867 OSCARQ8IYS5 282 aa44.8■■■■■ 4.76
RPLP2-202ENST00000524867 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.74■■■■■ 4.75
RPLP2-202ENST00000524867 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.68■■■■■ 4.74
RPLP2-202ENST00000524867 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.66■■■■■ 4.74
RPLP2-202ENST00000524867 TOP2BQ02880 1626 aa44.65■■■■■ 4.74
RPLP2-202ENST00000524867 SYNJ1O43426 1573 aa44.61■■■■■ 4.73
RPLP2-202ENST00000524867 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.58■■■■■ 4.73
RPLP2-202ENST00000524867 CHD1O14646 1710 aa44.55■■■■■ 4.72
RPLP2-202ENST00000524867 GRIN2BQ13224 1484 aa44.51■■■■■ 4.72
RPLP2-202ENST00000524867 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.5■■■■■ 4.71
RPLP2-202ENST00000524867 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.46■■■■■ 4.71
RPLP2-202ENST00000524867 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.46■■■■■ 4.71
RPLP2-202ENST00000524867 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
RPLP2-202ENST00000524867 PBRM1Q86U86 1689 aa44.42■■■■■ 4.7
RPLP2-202ENST00000524867 FBLN2P98095 1184 aa44.37■■■■■ 4.69
RPLP2-202ENST00000524867 SYNJ2O15056 1496 aa44.27■■■■■ 4.68
RPLP2-202ENST00000524867 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP44.21■■■■■ 4.67
RPLP2-202ENST00000524867 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
RPLP2-202ENST00000524867 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
RPLP2-202ENST00000524867 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa44.2■■■■■ 4.67
RPLP2-202ENST00000524867 ARHGEF11O15085 1522 aa44.15■■■■■ 4.66
RPLP2-202ENST00000524867 TRIM41Q8WV44 630 aa44.11■■■■■ 4.65
RPLP2-202ENST00000524867 CLASP1Q7Z460 1538 aa44.08■■■■■ 4.65
RPLP2-202ENST00000524867 ADAMTS12P58397 1594 aa44.06■■■■■ 4.64
RPLP2-202ENST00000524867 ERICH3Q5RHP9 1530 aa44.05■■■■■ 4.64
RPLP2-202ENST00000524867 GRIN2AQ12879 1464 aa43.95■■■■■ 4.63
RPLP2-202ENST00000524867 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.93■■■■■ 4.62
RPLP2-202ENST00000524867 ARAP1Q96P48 1450 aa43.77■■■■■ 4.6
RPLP2-202ENST00000524867 NUP160Q12769 1436 aa43.77■■■■■ 4.6
RPLP2-202ENST00000524867 KIF27Q86VH2 1401 aa43.77■■■■■ 4.6
RPLP2-202ENST00000524867 CEP170Q5SW79 1584 aa43.75■■■■■ 4.59
RPLP2-202ENST00000524867 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.67■■■■■ 4.58
RPLP2-202ENST00000524867 IGF1RP08069 1367 aa43.61■■■■■ 4.57
RPLP2-202ENST00000524867 CUL7Q14999 1698 aa43.59■■■■■ 4.57
RPLP2-202ENST00000524867 SHROOM2Q13796 1616 aa43.51■■■■■ 4.56
RPLP2-202ENST00000524867 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.43■■■■■ 4.54
RPLP2-202ENST00000524867 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.41■■■■■ 4.54
RPLP2-202ENST00000524867 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.35■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms