RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339266.9

DLGAP4-201, Transcript of DLG associated protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene DLGAP4, Length 5,016 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLGAP4-201ENST00000339266 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.21■■■■□ 3.23
DLGAP4-201ENST00000339266 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.88■■■■□ 3.17
DLGAP4-201ENST00000339266 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
DLGAP4-201ENST00000339266 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.26■■■□□ 2.91
DLGAP4-201ENST00000339266 EHMT2Q96KQ7 1210 aa32.02■■■□□ 2.72
DLGAP4-201ENST00000339266 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
DLGAP4-201ENST00000339266 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.91■■■□□ 2.54
DLGAP4-201ENST00000339266 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
DLGAP4-201ENST00000339266 TRIM41Q8WV44 630 aa30.83■■■□□ 2.53
DLGAP4-201ENST00000339266 APLP2Q06481 763 aa30.66■■■□□ 2.5
DLGAP4-201ENST00000339266 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP30.58■■■□□ 2.49
DLGAP4-201ENST00000339266 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
DLGAP4-201ENST00000339266 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.17■■■□□ 2.42
DLGAP4-201ENST00000339266 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.13■■■□□ 2.41
DLGAP4-201ENST00000339266 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa30.09■■■□□ 2.41
DLGAP4-201ENST00000339266 ABCC9O60706 1549 aa30■■■□□ 2.39
DLGAP4-201ENST00000339266 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
DLGAP4-201ENST00000339266 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
DLGAP4-201ENST00000339266 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
DLGAP4-201ENST00000339266 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
DLGAP4-201ENST00000339266 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
DLGAP4-201ENST00000339266 HRCP23327 699 aa29.38■■■□□ 2.29
DLGAP4-201ENST00000339266 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
DLGAP4-201ENST00000339266 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
DLGAP4-201ENST00000339266 ITGAEP38570 1179 aa29.23■■■□□ 2.27
DLGAP4-201ENST00000339266 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
DLGAP4-201ENST00000339266 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
DLGAP4-201ENST00000339266 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
DLGAP4-201ENST00000339266 SCRIBQ14160 1630 aa28.99■■■□□ 2.23
DLGAP4-201ENST00000339266 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
DLGAP4-201ENST00000339266 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.87■■■□□ 2.21
DLGAP4-201ENST00000339266 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.53■■■□□ 2.16
DLGAP4-201ENST00000339266 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
DLGAP4-201ENST00000339266 POLR3GLQ9BT43 218 aa28.43■■■□□ 2.14
DLGAP4-201ENST00000339266 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.43■■■□□ 2.14
DLGAP4-201ENST00000339266 NEFLP07196 543 aa28.4■■■□□ 2.14
DLGAP4-201ENST00000339266 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
DLGAP4-201ENST00000339266 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
DLGAP4-201ENST00000339266 P3H3Q8IVL6 736 aa28.33■■■□□ 2.13
DLGAP4-201ENST00000339266 NEUROD1Q13562 356 aa28.23■■■□□ 2.11
DLGAP4-201ENST00000339266 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
DLGAP4-201ENST00000339266 FBLN2P98095 1184 aa28.21■■■□□ 2.11
DLGAP4-201ENST00000339266 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.19■■■□□ 2.1
DLGAP4-201ENST00000339266 TRIM52Q96A61 297 aa28.15■■■□□ 2.1
DLGAP4-201ENST00000339266 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.14■■■□□ 2.1
DLGAP4-201ENST00000339266 ARID3CA6NKF2 412 aa28.14■■■□□ 2.1
DLGAP4-201ENST00000339266 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.05■■■□□ 2.08
DLGAP4-201ENST00000339266 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28■■■□□ 2.07
DLGAP4-201ENST00000339266 NACADO15069 1562 aa27.91■■■□□ 2.06
DLGAP4-201ENST00000339266 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
DLGAP4-201ENST00000339266 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.82■■■□□ 2.04
DLGAP4-201ENST00000339266 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
DLGAP4-201ENST00000339266 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
DLGAP4-201ENST00000339266 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
DLGAP4-201ENST00000339266 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa27.64■■■□□ 2.01
DLGAP4-201ENST00000339266 CLIP1P30622 1438 aa27.57■■■□□ 2
DLGAP4-201ENST00000339266 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.56■■■□□ 2
DLGAP4-201ENST00000339266 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
DLGAP4-201ENST00000339266 ANP32CO43423 234 aa27.54■■■□□ 2
DLGAP4-201ENST00000339266 CEP162Q5TB80 1403 aa27.51■■□□□ 1.99
DLGAP4-201ENST00000339266 BCANQ96GW7 911 aa27.5■■□□□ 1.99
DLGAP4-201ENST00000339266 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
DLGAP4-201ENST00000339266 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
DLGAP4-201ENST00000339266 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.43■■□□□ 1.98
DLGAP4-201ENST00000339266 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
DLGAP4-201ENST00000339266 GOLGA3Q08378 1498 aa27.4■■□□□ 1.98
DLGAP4-201ENST00000339266 EEA1Q15075 1411 aa27.37■■□□□ 1.97
DLGAP4-201ENST00000339266 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
DLGAP4-201ENST00000339266 SOGA1O94964 1423 aa27.27■■□□□ 1.96
DLGAP4-201ENST00000339266 TONSLQ96HA7 1378 aa27.27■■□□□ 1.96
DLGAP4-201ENST00000339266 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.26■■□□□ 1.96
DLGAP4-201ENST00000339266 MTUS2Q5JR59 1369 aa27.25■■□□□ 1.95
DLGAP4-201ENST00000339266 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
DLGAP4-201ENST00000339266 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
DLGAP4-201ENST00000339266 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.19■■□□□ 1.94
DLGAP4-201ENST00000339266 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
DLGAP4-201ENST00000339266 KIF27Q86VH2 1401 aa27.18■■□□□ 1.94
DLGAP4-201ENST00000339266 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.16■■□□□ 1.94
DLGAP4-201ENST00000339266 ABCC8Q09428 1581 aa27.15■■□□□ 1.94
DLGAP4-201ENST00000339266 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
DLGAP4-201ENST00000339266 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.08■■□□□ 1.93
DLGAP4-201ENST00000339266 WIZO95785 1651 aa27.06■■□□□ 1.92
DLGAP4-201ENST00000339266 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.04■■□□□ 1.925e-10■□□□□ 10.4
DLGAP4-201ENST00000339266 MIER1Q8N108 512 aa27.03■■□□□ 1.92
DLGAP4-201ENST00000339266 CLSPNQ9HAW4 1339 aa27.01■■□□□ 1.91
DLGAP4-201ENST00000339266 TSPY4P0CV99 314 aa26.94■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 TSPY10P0CW01 314 aa26.94■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 CHGAP10645 457 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.91■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 MYT1Q01538 1121 aa26.91■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 CUX2O14529 1486 aa26.89■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.89■■□□□ 1.9
DLGAP4-201ENST00000339266 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.89■■□□□ 1.892e-6■■■■□ 20.5
DLGAP4-201ENST00000339266 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.85■■□□□ 1.89
DLGAP4-201ENST00000339266 KCNH8Q96L42 1107 aa26.84■■□□□ 1.89
DLGAP4-201ENST00000339266 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.84■■□□□ 1.89
DLGAP4-201ENST00000339266 FKBP8Q14318 412 aa26.84■■□□□ 1.89
DLGAP4-201ENST00000339266 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
DLGAP4-201ENST00000339266 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.77■■□□□ 1.88
DLGAP4-201ENST00000339266 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms