Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LDB2O43679 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LDB2O43679 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LDB2O43679 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LDB2O43679 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LDB2O43679 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LDB2O43679 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LDB2O43679 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LDB2O43679 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LDB2O43679 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LDB2O43679 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms