Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6K0

IGLV3-16, Immunoglobulin lambda variable 3-16, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-16A0A075B6K0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGLV3-16A0A075B6K0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGLV3-16A0A075B6K0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
IGLV3-16A0A075B6K0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IGLV3-16A0A075B6K0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms