Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ACSL6Q9UKU0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ACSL6Q9UKU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ACSL6Q9UKU0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms