Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS51Q9UID3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS51Q9UID3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms