Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLCO1B3Q9NPD5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLCO1B3Q9NPD5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLCO1B3Q9NPD5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms