Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKAP1Q86WV1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKAP1Q86WV1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms