Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK5Q00535 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK5Q00535 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms