Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPP08247 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPP08247 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPP08247 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPP08247 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYPP08247 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYPP08247 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPP08247 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPP08247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPP08247 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPP08247 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYPP08247 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYPP08247 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYPP08247 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYPP08247 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYPP08247 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPP08247 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPP08247 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYPP08247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPP08247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYPP08247 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYPP08247 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYPP08247 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SYPP08247 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYPP08247 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SYPP08247 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms