Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APODP05090 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
APODP05090 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APODP05090 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
APODP05090 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APODP05090 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
APODP05090 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APODP05090 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APODP05090 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
APODP05090 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
APODP05090 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APODP05090 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APODP05090 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APODP05090 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
APODP05090 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
APODP05090 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APODP05090 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
APODP05090 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APODP05090 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms