Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHA13Q9Y5I0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCDHA13Q9Y5I0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHA13Q9Y5I0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHA13Q9Y5I0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms