Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDZRN3Q9UPQ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDZRN3Q9UPQ7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms