Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NSUN3Q9H649 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NSUN3Q9H649 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NSUN3Q9H649 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NSUN3Q9H649 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms