Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TIMM29Q9BSF4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM29Q9BSF4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms