Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ANKRD53Q8N9V6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ANKRD53Q8N9V6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms