Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CCDC93Q567U6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC93Q567U6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC93Q567U6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC93Q567U6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms