Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SVEP1Q4LDE5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SVEP1Q4LDE5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SVEP1Q4LDE5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.8 ms