Protein–RNA interactions for Protein: P36405

ARL3, ADP-ribosylation factor-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL3P36405 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARL3P36405 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARL3P36405 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARL3P36405 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ARL3P36405 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ARL3P36405 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL3P36405 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ARL3P36405 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms