Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBSP08397 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBSP08397 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBSP08397 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBSP08397 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HMBSP08397 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HMBSP08397 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HMBSP08397 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMBSP08397 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMBSP08397 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMBSP08397 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMBSP08397 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HMBSP08397 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HMBSP08397 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HMBSP08397 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HMBSP08397 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HMBSP08397 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HMBSP08397 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMBSP08397 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMBSP08397 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMBSP08397 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMBSP08397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMBSP08397 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMBSP08397 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMBSP08397 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms