Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRABD2BA6NFA1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRABD2BA6NFA1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABD2BA6NFA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABD2BA6NFA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRABD2BA6NFA1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms