Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR31

SAR1A, GTP-binding protein SAR1a, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1AQ9NR31 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SAR1AQ9NR31 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SAR1AQ9NR31 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SAR1AQ9NR31 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms