Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM2Q9C040 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM2Q9C040 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms