Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDRT15Q96T59 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDRT15Q96T59 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDRT15Q96T59 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms