Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PAN3Q58A45 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAN3Q58A45 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAN3Q58A45 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms